Facture électronique : le rôle crucial de l’expert-comptable dans l’accompagnement des TPE-PME

Où en sont les TPE-PME face à la réforme de la facture électronique ?

D’après le sondage réalisé par Qonto avec OpinionWay* en mars 2026, seuls 18 % des entrepreneurs se disent aujourd’hui déjà équipés pour répondre aux exigences de la réforme.

À quelques mois de l’échéance du 1er septembre 2026, ces chiffres illustrent un retard encore important. Ils révèlent aussi une opportunité majeure pour les experts-comptables : aider les entreprises à comprendre la réforme, à anticiper les prochaines étapes et à transformer une obligation réglementaire en un chantier utile d’amélioration des processus.

Au sens de la réforme, une facture électronique renvoie à une définition relativement technique : il s’agit d’une facture dont les données respectent une structure particulière et qui sont envoyées automatiquement à l’administration fiscale via une Plateforme Agréée (PA), anciennement appelée PDP (Plateforme de Dématérialisation Partenaire). Elles auraient également pu l'être via le PPF (portail public de facturation), mais son développement a été abandonné par l'État en octobre 2024. 

Le sondage réalisé par Qonto avec OpinionWay met en évidence une méconnaissance persistante des implications concrètes de la réforme au sein des TPE-PME. Si 76 % des répondants déclarent avoir entendu parler de la réforme, cette notoriété masque une compréhension encore partielle du sujet : 37 % disent en avoir entendu parler sans en comprendre les implications concrètes, et 24 % n’ont pas connaissance des changements à venir.

Par conséquent, de nombreuses entreprises sous-estiment encore l’effort de mise en conformité qu’elles devront fournir. Si 18 % se disent déjà équipées pour faire face à la réforme, 21 % seulement prévoient de s’équiper rapidement. À quelques mois de l’échéance, ces chiffres montrent que le passage à l’action reste encore limité.

Ces résultats confirment donc un véritable besoin de pédagogie autour du concept de facture électronique, mais aussi autour des aspects techniques de la réforme, des nouvelles obligations qu’elle implique et des adaptations concrètes qu’elle suppose pour les entreprises.

À l’approche de l’échéance du 1er septembre 2026, la réforme n’est plus un sujet lointain. Les TPE-PME doivent progressivement se mettre en ordre de marche, au minimum pour être prêtes à recevoir des factures électroniques.

Pour y parvenir, elles ont besoin :

• d’une pédagogie simple sur les notions clés (format structuré, transmission, e-invoicing, e-reporting) ;
  
  
• d’une feuille de route qui transforme la réforme en actions concrètes (outillage, process, responsabilités, calendrier) ;
  
  
• d’aide pour faire les bons arbitrages, notamment lorsque plusieurs solutions et scénarios coexistent.

Le sondage réalisé par Qonto avec OpinionWay s’est intéressé aux partenaires vers lesquels les TPE-PME se tournent en priorité face à cette réforme, que ce soit pour s’informer ou pour se faire accompagner.

Sur ce sujet, l’expert-comptable reste l’interlocuteur le plus cité. 27 % des répondants déclarent se tourner en priorité vers lui, devant les autorités publiques (21 %) et leur réseau professionnel (19 %). Les éditeurs de logiciels de comptabilité ou de facturation arrivent ensuite, à 15 %, au même niveau que les banques et outils financiers. Par ailleurs, 29 % des entrepreneurs déclarent ne pas encore s’être renseignés.

Cette tendance est encore plus marquée au sein des entreprises ayant des salariés, où 51 % des répondants disent se tourner en priorité vers leur expert-comptable, contre 17 % chez les auto-entrepreneurs.

Autrement dit, l’expert-comptable est déjà identifié comme un point d’entrée naturel. L’enjeu, désormais, est de traduire cette confiance en accompagnement clair, concret et actionnable. Cela peut aussi passer par des dispositifs concrets, comme le mandat PA, qui facilite certaines démarches et renforce l’accompagnement du client dans la durée.

Si la réforme de la facture électronique est aujourd'hui connue de nom par une majorité de TPE-PME, elle reste encore mal comprise dans ses implications concrètes. Les résultats du sondage réalisé par Qonto avec OpinionWay montrent en effet qu'une part importante des entrepreneurs manque encore de visibilité sur le sujet : 37 % déclarent avoir entendu parler de la réforme sans en comprendre précisément les implications, et 24 % n'ont pas connaissance des changements à venir.

Ce décalage entre notoriété et compréhension réelle montre à quel point le besoin d'information reste important. Car au-delà du principe même de la facture électronique, la réforme implique des évolutions très concrètes dans les pratiques des entreprises, dans leurs outils, mais aussi dans leur organisation administrative et comptable.

Cette réforme implique deux grandes obligations : l'e-invoicing (l'obligation d'émettre et de recevoir des factures dans un format structuré via une PA) et l'e-reporting, qui impose de transmettre à l'administration fiscale certaines données sur les transactions non couvertes par la facturation électronique. Sur ce dernier point, le constat est particulièrement préoccupant : 61 % des entrepreneurs jugent la mise en conformité e-reporting difficile, et seuls 21 % déclarent vraiment comprendre ce que cela implique.

Dans ce contexte, les experts-comptables ont un rôle pédagogique essentiel à jouer auprès de leurs clients, notamment sur la structure et le format d'une facture électronique au sens de la réforme, les nouvelles obligations imposées, en matière d'e-invoicing comme d'e-reporting, et les échéances à anticiper et les étapes concrètes pour s'y préparer.

Avant toute chose, l’enjeu est d’évaluer précisément le niveau de maturité du client face à la réforme, afin d’identifier ses zones de flou, ses besoins prioritaires et les premiers chantiers à ouvrir. Cela peut aussi passer par le fait d’identifier les clients concernés et de prioriser ceux qui auront besoin d’un accompagnement renforcé.

Voici quelques questions clés à traiter avec le client :

• Le client comprend-il la différence entre facture électronique, PDF et email ?
  
  
• Quel est l’outillage actuel (facturation, ERP, caisse, e-commerce) ?
  
  
• Quel volume de factures (émises et reçues) et quelles spécificités (B2B, B2C, international) ?
  
  
• Qui portera le projet côté client (finance, admin, direction) ?

Une fois ce diagnostic posé, l’expert-comptable peut aider son client à définir une trajectoire de mise en conformité claire, réaliste et adaptée à son organisation. Cela suppose notamment de :

• Vérifier la compatibilité du logiciel de facturation avec la nouvelle norme.
  
  
• Identifier le bon mode opératoire (selon le fonctionnement du client et ses contraintes).
  
  
• Choisir une Plateforme Agréée (PA) adaptée à l’activité.
  
  
• Définir un calendrier en distinguant ce qui doit être prêt à court terme de ce qui peut être progressivement amélioré.
  
  
• Prévoir, lorsque cela est pertinent, la mise en place d’un mandat PA pour faciliter certaines démarches opérationnelles.

L’étape suivante consiste à traduire cette mise en conformité dans les process quotidiens de l’entreprise, pour qu’elle soit réellement opérationnelle. Cela passe notamment par les actions suivantes :

• Définir les nouveaux gestes (réception, traitement, émission, suivi).
  
  
• Clarifier les responsabilités et les validations.
  
  
• Former les personnes concernées.
  
  
• Préparer une communication simple : ce qui change, ce qui ne change pas, et comment demander de l’aide.

Enfin, pour favoriser l’adhésion, il est essentiel d’aider les entreprises à voir la réforme non seulement comme une contrainte réglementaire, mais aussi comme une opportunité d’améliorer durablement leurs pratiques.

La transition sera en effet plus simple pour les entreprises qui considéreront la réforme comme une opportunité, plutôt que comme une contrainte de plus.

Les impacts positifs de la réforme sont bien réels : elle est l’occasion pour les entreprises de moderniser leurs processus de facturation, de simplifier une partie de leurs démarches administratives et d’améliorer le suivi de leur activité.

À ce stade, la perception reste néanmoins largement marquée par les contraintes. D’après le sondage réalisé par Qonto avec OpinionWay, 57 % des entrepreneurs associent la réforme à un coût supplémentaire, et 53 % à une complexité accrue.

Les entreprises déjà équipées en perçoivent toutefois plus clairement les bénéfices, notamment en matière de simplification administrative et de gain de temps. Les experts-comptables ont donc tout intérêt à s’appuyer sur ces retours concrets et à valoriser d’autres avantages de la réforme, comme une meilleure fiabilité des données, une gestion plus fluide ou encore l’accélération des paiements, afin de rendre la mise en conformité la plus indolore possible.

En tant que partenaires clés, les experts-comptables ont donc un rôle décisif à jouer auprès des TPE-PME dans leur transition vers la facture électronique.

Et c’est une excellente nouvelle pour eux : en proposant un accompagnement de qualité, ils mettront en avant la valeur de leur service auprès de leurs clients, et endosseront ainsi un rôle de véritable partenaire stratégique.

La transition sera plus simple pour les entreprises qui considéreront la réforme comme une opportunité, plutôt que comme une contrainte supplémentaire. Pour les experts-comptables, c’est aussi l’occasion de renforcer un positionnement à forte valeur ajoutée, en passant d’une logique de traitement à une logique d’accompagnement, avec des conseils structurés, un calendrier et des étapes claires.

Pour proposer un accompagnement plus fluide, les experts-comptables peuvent s’appuyer sur des solutions qui facilitent la mise en conformité opérationnelle : la Plateforme Agréée Qonto simplifie la transition de leurs clients TPE-PME vers la facture électronique.

*Étude réalisée par OpinionWay pour Qonto auprès d’un échantillon de 303 entrepreneurs constitué selon la méthode des quotas. Interviews réalisées en ligne, via un questionnaire autoadministré (CAWI), du 16 au 22 mars 2026.